Genotipleme ve Fenotipleme, HIV İlaç Direncini Belirleyebilir ve Öngörebilir
Tedaviye optimal uyum gösteren kişiler için bile, virüsün doğal mutasyonları nedeniyle zamanla bir miktar HIV ilaç direncinin gelişmesi beklenir. Diğer durumlarda, suboptimal aderansın dirençli HIV popülasyonlarının gelişmesine olanak sağlaması ve sonuçta tedavi başarısızlığına yol açması durumunda direnç hızla gelişebilir.
Tedavi başarısızlığı ortaya çıktığında, bu yeni dirençli virüs popülasyonunu baskılamak için alternatif ilaç kombinasyonları seçilmelidir.
Genetik direnç testi , bu virüslerin olası antiretroviral ajanlara ne kadar duyarlı olduğunu belirlerken, bir kişinin "viral havuzunda" dirençli mutasyon türlerini tanımlayarak bunu kolaylaştırmaya yardımcı olur.
HIV'de genetik direnç testi için iki temel araç kullanılır: HIV genotipik testi ve HIV fenotipik testi .
Bir Genotip ve Fenotip Nedir?
Tanım olarak, bir genotip bir organizmanın genetik yapısıdır, fenotip ise bu organizmanın gözlenebilir özellikleri veya özellikleridir.
Genotipik analizler (veya genotipleme), bir hücrenin genetik kodlaması veya DNA içindeki kalıtsal talimatları tanımlayarak çalışır. Fenotipik analizler (veya fenotipleme), farklı çevresel koşulların etkisi altında bu talimatların ifadesini doğrular.
Genotip ve fenotip arasındaki ilişki mutlak olmamakla birlikte, genotipleme, özellikle genetik koddaki değişikliklerin, uyuşturucu direncinin gelişmesi durumunda olduğu gibi, özelliklerde veya özelliklerde beklenen değişikliklere yol açtığı durumlarda, fenotipin öngörüsü olabilir.
Diğer yandan fenotipleme, "şimdi ve şimdi" yi doğrular. HIV'in farklı ilaçlara ve / veya ilaç konsantrasyonlarına maruz kalması gibi bir organizmanın çevre basıncındaki belirli değişikliklere tepkisini değerlendirmeyi amaçlamaktadır.
HIV Genotipini Açıklamak
HIV genotipleme genellikle direnç testi için kullanılan en yaygın teknolojidir.
Tahlilin amacı, virüsün genomunun (veya genetik kodun) gag-pol bölgesindeki spesifik genetik mutasyonları tespit etmektir. Bu, ters transkriptaz, proteaz ve integraz enzimlerin (çoğu antiretroviral ilaçların hedefleri) DNA zinciri üzerinde kodlanmış olduğu bölgedir.
İlk olarak polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknolojisi kullanılarak HIV genomunun çoğaltılmasıyla, laboratuar teknisyenleri çeşitli mutasyon tespit teknolojileri kullanarak virüsün genetiğini sıralayabilir (veya "haritalayabilir").
Bu mutasyonlar ve mutasyonların farklı antiretroviral ilaçlara karşı beklenen duyarlılığı arasındaki ilişkiyi analiz eden teknisyenler tarafından mutasyon mutasyonları (veya mutasyonların birikmesi) yorumlanır. Çevrimiçi veritabanları, test dizisini bir prototip "vahşi tip" virüsünkiyle karşılaştırmaya yardımcı olabilir (yani, dirençli mutasyon içermeyen HIV).
Bu testlerin yorumlanması, ilaca karşı daha fazla direnç sağlayan anahtar mutasyonların sayısı ile ilaç duyarlılığını belirlemek için kullanılır.
HIV Phenoytyping'in Açıklanması
HIV fenotiplemesi, bir ilacın varlığında kişinin HIV'sinin büyümesini değerlendirir, daha sonra bunu, aynı ilacın içinde bir kontrol, vahşi tip virüsün büyümesi ile karşılaştırır.
Genotipik testlerde olduğu gibi, fenotipik testler, HIV genomunun gag-pol bölgesini güçlendirir.
Genetik kodun bu bölümü, daha sonra rekombinant DNA teknolojisi kullanılarak bir vahşi tip klon üzerine "aşılanır". Elde edilen rekombinant virüs, memeli hücrelerini in vitro (laboratuarda) enfekte etmek için kullanılır.
Viral numune daha sonra% 50 ve% 90 viral supresyona ulaşılana kadar artan farklı antiretroviral ilaç konsantrasyonlarına maruz bırakılır. Konsantrasyonlar daha sonra kontrol, vahşi tip numuneden elde edilen sonuçlarla karşılaştırılır.
Göreceli "katlama" değişiklikleri, ilaç duyarlılığının belirlendiği değer aralığını sağlar. Dört kat değişiklik, vahşi tip ile karşılaştırıldığında viral supresyona ulaşmak için ilacın miktarının dört katına ihtiyaç duyulduğu anlamına gelir.
Katlama değeri ne kadar büyükse, virüs belirli bir ilaca daha az duyarlıdır.
Bu değerler daha sonra, daha yüksek ilaç direnci seviyelerine ulaşan üst değerler ile daha düşük klinik ve üst klinik aralıklarına yerleştirilir. ( Örnek rapora bakınız.)
Genetik Direnç Testi Ne Zaman Yapılır?
ABD'de, herhangi bir “edinilmiş” ilaç direncine sahip olup olmadıklarını belirlemek için geleneksel olmayan hastalarda tedaviye genetik direnç testi yapılmaktadır. ABD'deki çalışmalar, bulaşan virüsün % 6 ila% 16'sı en az bir antiretroviral ilaca dirençli olacağını, yaklaşık% 5'inin birden fazla ilaç sınıfına dirençli olacağını göstermektedir.
Genetik direnç testi, terapi gören bireylerde ilaç direncinden şüphelenildiğinde da kullanılır. Viral yük 500 kopya / mL'den büyükse, hasta ya başarısız rejimi alırken ya da tedavinin kesilmesinden sonraki dört hafta içinde test yapılır. Bu örneklerde genotipik test genellikle daha az maliyetli olduğundan, daha hızlı bir geri dönüş süresine sahip olduklarından ve vahşi tip ve dirençli virüslerin karışımlarını tespit etmek için daha fazla hassasiyet sundukları için tercih edilir.
Özellikle proteaz inhibitörlerine maruz kalanlar için kompleks, çoklu ilaç direnci olan kişiler için fenotipik ve genotipik testlerin bir kombinasyonu tercih edilir.
Kaynaklar:
Dünya Sağlık Örgütü (WHO). "HIV İlaç Direnci Bilgi Sayfası." Cenevre, İsviçre; 11 Nisan 2011.
Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; ve diğ. "Aktarılan HIV-1 ARV ilaca dirençle ilişkili mutasyonlar trendi: 10 HIV sürveyans alanı, ABD, 2007-2010." Retrovirüsler ve Fırsatçı İnfeksiyonlar 20. Konferansı. Atlanta, Gürcistan; 6 Mart 2013; Sözlü özet 149.
Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH). "HIV-1 Enfekte Yetişkinlerde ve Adolesanlarda Antiretroviral Maddelerin Kullanımı için Kılavuzlar." Bethesda, Maryland; Ekim 11, 2013.