Situ Hibridizasyonunda Floresans
Flüoresan in situ hibridizasyon (FISH), hücrelerin DNA'sını aramak, belirli genlerin veya gen kısımlarının varlığını veya yokluğunu aramak için kullanılan çeşitli tekniklerden biridir.
Birçok farklı kanser türü, bilinen genetik anormalliklerle ilişkilidir. Ve genetik olarak, sadece kalıtımdan bahsetmiyoruz. Bir ömür boyunca, hücreler bölündüklerinde ve büyüdüklerinde hata yapabilirler.
Bu hücrelerde kansere bağlı DNA'daki mutasyonlar birikebilir.
FISH Nasıl Çalışır?
FISH, belirli genleri veya gen kısımlarını (DNA dizileri) tespit etmek için floresan probları kullanan bir tekniktir. Tıp merkezi laboratuvar personeli ve onkologlar, FISH'ı kansere yakalanmış hastaları değerlendirmek ve bazen kanser teşhisi konmuş ve tedavi edilen bir hastayı izlemek için kullanır.
FISH, bölgeye ve şüphelenilen kanserin türüne göre çeşitli tipte örnekler kullanılarak yapılabilir: Periferik kandan elde edilen tümör hücreleri , kemik iliği biyopsisinden veya lenf düğümü biyopsisinden ve formalinle sabitlenmiş parafine gömülmüş dokudan ( Laboratuarda işlenen ve bir tür balmumu içine gömülmüş, daha sert hale getiren, ince kesitlere dilimlenebildiği ve mikroskop altında görüntülenmesi için monte edilmiş bir doku örneği.
Mektuplar ne anlama geliyor?
FISH'de “H” hibridizasyona işaret eder.
Moleküler hibridizasyonda, bir prob olarak bir etiketli DNA veya RNA dizisi kullanılır - eğer isterseniz, bir kırmızı Lego tuğla görselleştirmek. Sonda, biyolojik bir örnekte bir karşıt Lego tuğla veya DNA dizisi bulmak için kullanılır.
Örneğindeki DNA, Lego tuğlalarının yığınları gibidir ve bu yığınlardaki çoğu tuğla bizim kırmızı probumuzla uyuşmaz.
Ve tüm tuğlalarınız düzgün bir şekilde 23 çift tuğla kazık olarak düzenlenmiştir - her bir kazık, eşlenmiş homolog kromozomlardan biridir, az çok. Lego tuğlalarından farklı olarak, bizim kırmızı Lego probumuz güçlü bir mıknatıs gibidir ve kazıkların arasından sıyrılmak zorunda kalmadan maçını bulur.
“F”, flüoresan anlamına gelir. Kırmızı probumuz tuğla yığınlarında kaybolabilir, bu nedenle renkli floresan boya ile işaretlenir, böylece parlayacaktır. Eşleştirilmiş 23 kazık arasında bir eşleşme bulduğunda, bir floresan etiketi yerini gösterir. Yani şimdi, araştırmacıların ve klinisyenlerin, belirli bir genin belirli bir genin nerede olduğunu (hangi kazık veya hangi kromozomun) konumlandığını belirlemek için FISH'i nasıl kullanabileceklerini görebilirsiniz.
In situ için “I” ve “S” standı. Bu, kırmızı Lego tuğlamızın verdiğiniz örnek içindeki eşleşmeyi aradığı gerçeğini ifade eder.
Spesifik Kan Kanserleri Nedir?
FISH ve diğer in situ hibridizasyon prosedürleri, çeşitli kromozomal anormalliklerin teşhisinde kullanılır - genetik materyaldeki değişiklikler, aşağıdakiler dahil olmak üzere kromozomlardaki değişiklikler:
Silme - bir kromozomun parçası gitti
Translokasyon - bir kromozomun parçası kırılır ve başka bir kromozoma yapışır
Inversiyon - bir kromozomun parçası kırılır ve tekrar tersine sırayla yeniden yerleştirilir.
Çoğaltma - bir kromozomun parçası, hücre içinde çok fazla kopyada bulunur
Her bir kanser türü, kendi kromozom değişiklikleri ve ilgili sondalara sahip olabilir. FISH sadece kanser gibi bir hastalık sürecindeki ilk genetik değişiklikleri tanımlamaya yardımcı olmakla kalmaz, aynı zamanda tedaviye yanıtı ve hastalık remisyonunu izlemek için de kullanılabilir.
FISH tarafından tespit edilen genetik değişiklikler, bazen aynı kansere ve benzer genetik değişikliklere sahip kişilerde geçmişte gözlemlenenlere dayanarak, bir bireyin kanserinin nasıl davranacağına dair ek bilgi sunmaktadır. Bazen FISH tanısı yapıldıktan sonra, hastanın sonucunu veya en iyi tedaviyi tahmin etmede yardımcı olabilecek ek bilgileri toplamak için kullanılır.
FISH, kronik lenfositik lösemi (KLL) dahil olmak üzere lösemilerde kromozomal anormallikleri tanımlayabilir. FISH, kronik lenfositik lösemi / küçük lenfositik lenfoma için, hastaların prognostik kategorilerini bulmalarına izin verir: iyi, orta veya kötü. Akut lenfoblastik lösemide (ALL), lösemik hücrelerin genetiği sizi kanser risk düzeyini anlatabilir ve terapötik kararları yönlendirmeye yardımcı olabilir.
FISH panelleri ayrıca lenfoma, multipl miyelom, plazma hücre proliferatif bozuklukları ve miyelodisplastik sendrom için de mevcuttur. Mantle hücre lenfoması söz konusu olduğunda, örneğin, FISH'in bu lenfoma ile sıklıkla ilişkili olan GH / CCND1 t (11; 14) adlı tespit edilebildiği bir translokasyon vardır.
Neden FISH?
FISH'in bir avantajı, aktif olarak bölünen hücreler üzerinde gerçekleştirilmesi gerekmemesidir. Sitogenetik test genellikle yaklaşık üç hafta sürer, çünkü kanser hücreleri test edilmeden önce yaklaşık 2 hafta boyunca laboratuarda yetiştirilmelidir. Buna karşılık, FISH sonuçları genellikle birkaç gün içinde laboratuardan temin edilebilir.
> Kaynaklar:
> Kanser Sitogenetik Test CPT Kodları.
> Situ Hibridizasyonunda Flüoresan (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Situ Hibridizasyonunda Flüoresan (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD ve diğ. Hematolojik Bozukluklarda Situ Hibridizasyon Testinde Floresan Rehberliği. Moleküler Diagnostik Dergisi: JMD. 2007, 9 (2): 134-143.